Uso Inno Script Studio, tu puedes seguir usando el que quieras (aunque ISS es igual de sencillo y creo que mejora un poco XD), lo unico que cambia en la nueva version 6.4.3 de inno setup es que tienes que decirle que NO esconda la primera pantalla de bienvenida del setup:
Esa opcion que te muestro esta activada por defecto con el nuevo inno setup, si quieres que siga saliendo la pantalla inicial de bienvenida del setup tienes que acordarte de desmarcarla.
Y otra "cosilla", si quieres cambiar el icono del nuevo setup (en la version 6.4.3 cambia el icono) tienes que añadir esto:
SetupIconFile=compiler:icon.ico en la seccion Setup:
Para que funcione el icono que quieras usar tiene que estar en la carpeta de inno setup y llamarse icon.ico, si se llamara icono123.ico pues deberias usar la frase: SetupIconFile=compiler:icono123.ico
Son los 2 cambios mas... notables en la nueva versión, y por si acaso te gustaba el icono que se usaba por defecto te dejo aquí adjunto el que podrias usar ahora, es como el que usaba la 5.5.5 por defecto pero de mayor tamaño (256x256) para que se vea mejor.